Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uchl5Q9WUP7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uchl5Q9WUP7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uchl5Q9WUP7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Uchl5Q9WUP7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uchl5Q9WUP7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Uchl5Q9WUP7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uchl5Q9WUP7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms