Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sorbs3Q9R1Z8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sorbs3Q9R1Z8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sorbs3Q9R1Z8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms