Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hic1Q9R1Y5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hic1Q9R1Y5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hic1Q9R1Y5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms