Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf103Q9R1W3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf103Q9R1W3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf103Q9R1W3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms