Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma1Q9R1P4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Psma1Q9R1P4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psma1Q9R1P4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Psma1Q9R1P4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Psma1Q9R1P4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms