Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmb2Q9R1P3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmb2Q9R1P3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Psmb2Q9R1P3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms