Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubd1Q9R1K7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubd1Q9R1K7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubd1Q9R1K7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubd1Q9R1K7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms