Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trex2Q9R1A9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trex2Q9R1A9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trex2Q9R1A9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms