Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt71Q9R0H5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt71Q9R0H5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krt71Q9R0H5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms