Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Lamc3Q9R0B6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Lamc3Q9R0B6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lamc3Q9R0B6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Lamc3Q9R0B6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Lamc3Q9R0B6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Lamc3Q9R0B6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms