Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rnf25Q9QZR0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf25Q9QZR0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf25Q9QZR0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf25Q9QZR0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms