Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kcnip3Q9QXT8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Kcnip3Q9QXT8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms