Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Apbb1Q9QXJ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Apbb1Q9QXJ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apbb1Q9QXJ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Apbb1Q9QXJ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms