Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim44Q9QXA7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim44Q9QXA7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim44Q9QXA7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim44Q9QXA7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim44Q9QXA7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms