Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PdcQ9QW08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PdcQ9QW08 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PdcQ9QW08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PdcQ9QW08 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms