Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trpc4Q9QUQ5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc4Q9QUQ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4Q9QUQ5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc4Q9QUQ5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms