Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdkl2Q9QUK0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdkl2Q9QUK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdkl2Q9QUK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms