Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PolkQ9QUG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PolkQ9QUG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolkQ9QUG2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolkQ9QUG2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms