Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LitafQ9JLJ0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LitafQ9JLJ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LitafQ9JLJ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms