Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Msrb1Q9JLC3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Msrb1Q9JLC3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Msrb1Q9JLC3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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