Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a3Q9JKZ2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a3Q9JKZ2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms