Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pole3Q9JKP7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pole3Q9JKP7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pole3Q9JKP7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms