Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyp39a1Q9JKJ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms