Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Mrpl39Q9JKF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Mrpl39Q9JKF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms