Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herpud2Q9JJC9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herpud2Q9JJC9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herpud2Q9JJC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herpud2Q9JJC9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herpud2Q9JJC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herpud2Q9JJC9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Herpud2Q9JJC9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Herpud2Q9JJC9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Herpud2Q9JJC9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms