Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1fQ9JIS7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1fQ9JIS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1fQ9JIS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cacna1fQ9JIS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms