Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup50Q9JIH2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup50Q9JIH2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup50Q9JIH2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms