Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp1r3fQ9JIG4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp1r3fQ9JIG4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppp1r3fQ9JIG4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp1r3fQ9JIG4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms