Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EefsecQ9JHW4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EefsecQ9JHW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EefsecQ9JHW4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EefsecQ9JHW4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms