Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ4

Nckipsd, NCK-interacting protein with SH3 domain, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NckipsdQ9ESJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NckipsdQ9ESJ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NckipsdQ9ESJ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NckipsdQ9ESJ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NckipsdQ9ESJ4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms