Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a4bQ9ES61 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a4bQ9ES61 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ms4a4bQ9ES61 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms