Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim54Q9ERP3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim54Q9ERP3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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