Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col4a3bpQ9EQG9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col4a3bpQ9EQG9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col4a3bpQ9EQG9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms