Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nif3l1Q9EQ80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nif3l1Q9EQ80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nif3l1Q9EQ80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms