Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc38a3Q9DCP2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc38a3Q9DCP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc38a3Q9DCP2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc38a3Q9DCP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms