Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde1Q9DBZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde1Q9DBZ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms