Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DA42 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DA42 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DA42 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DA42 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DA42 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9DA42 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9DA42 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9DA42 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9DA42 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9DA42 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DA42 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DA42 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9DA42 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9DA42 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9DA42 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9DA42 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9DA42 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9DA42 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9DA42 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9DA42 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9DA42 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9DA42 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9DA42 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q9DA42 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DA42 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DA42 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DA42 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DA42 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DA42 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q9DA42 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9DA42 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9DA42 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9DA42 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q9DA42 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9DA42 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9DA42 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9DA42 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9DA42 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9DA42 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DA42 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DA42 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DA42 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9DA42 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9DA42 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9DA42 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9DA42 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9DA42 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9DA42 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DA42 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DA42 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DA42 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DA42 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9DA42 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DA42 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DA42 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DA42 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DA42 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DA42 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9DA42 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DA42 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DA42 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9DA42 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9DA42 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9DA42 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9DA42 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9DA42 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9DA42 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9DA42 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9DA42 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9DA42 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9DA42 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9DA42 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9DA42 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9DA42 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9DA42 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9DA42 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9DA42 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9DA42 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9DA42 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms