Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Samd8Q9DA37 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Samd8Q9DA37 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms