Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzd9Q9D9M4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzd9Q9D9M4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pdzd9Q9D9M4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
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