Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnot8Q9D8X5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnot8Q9D8X5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cnot8Q9D8X5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms