Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam3aQ9D8T0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam3aQ9D8T0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam3aQ9D8T0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fam3aQ9D8T0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms