Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lin37Q9D8N6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lin37Q9D8N6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Lin37Q9D8N6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms