Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn23Q9D7D7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn23Q9D7D7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn23Q9D7D7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn23Q9D7D7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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