Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ttc9bQ9D6E4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ttc9bQ9D6E4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ttc9bQ9D6E4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms