Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms