Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pus10Q9D3U0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pus10Q9D3U0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pus10Q9D3U0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pus10Q9D3U0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pus10Q9D3U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms