Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim42Q9D2H5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim42Q9D2H5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trim42Q9D2H5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trim42Q9D2H5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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