Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ss18l2Q9D174 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l2Q9D174 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ss18l2Q9D174 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms