Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rfc5Q9D0F6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rfc5Q9D0F6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rfc5Q9D0F6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rfc5Q9D0F6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms