Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rrs1Q9CYH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rrs1Q9CYH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rrs1Q9CYH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rrs1Q9CYH6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms